Huarte está situada en la zona central de Navarra, concretamente en la Comarca de Pamplona, al nordeste de la capital. Se encuentra en la confluencia de la carretera nacional N-135, Pamplona-Francia por Valcarlos, que coincide, además, en este tramo, con la ronda este de circunvalación de Pamplona y de la comarcal NA-150, Pamplona-Aoiz-Lumbier.

También existe la carretera local Huarte-Villava. El hecho de que dicha ronda este pase por la parte oriental del pueblo coloca a Huarte en un nivel inmejorable en cuanto a comunicaciones se refiere, tanto con Pamplona como con comunidades vecinas o Francia.